荧光实时定量技术(Real-Time PCR,qPCR)是当前一项常用的生物技术。该技术1996年由美国Applied Biosystems公司推出,经过二十多年的发展,现已广泛用于生物、临床、食品、转基因等多种领域的定性、定量研究。qPCR扩增试剂是qPCR实验中不可或缺的产品,也是决定qPCR实验结果稳定性、可靠性的重要因素。在qPCR预混液产品中,我们常常会看到No ROX和with ROX的不同类型,那么什么是ROX,产品又该如何选择呢?
一、什么是ROX
ROX(Passive Reference Dye)是一种惰性参比染料,在PCR反应中能被PCR仪检测到。它不参与PCR反应,且荧光信号值是稳定的,不会随着PCR扩增发生改变。qPCR实验过程中存在很多引起孔间差异的因素,例如不均匀的照明、孔与孔之间液滴、气泡等光学因素的影响(图1),反应体系的浓度差异。此时,可以选择ROX作为阳性参比,对其他荧光信号进行归一化校正,以提高数据的精确度。
(图1)
*在PCR过程中,如果使用的PCR反应板封膜质量不好,受到水蒸气的影响,容易产生变形,从而引起“光学扭曲”现象(optical warping)。使用了ROX作为参比染料后,可有效校正因这种变形引起的荧光信号变化。加入ROX进行校正,不仅是可以消除由于激发光强和检测光强引起的误差,而且可以消除加入MASTERMIX的误差。
二、注意事项
ROX是ABI的专有染料,加在反应体系中之后用以平衡荧光强度的管间差。即在一批配制的反应液中的ROX浓度是一样的,这样,它们不同管之间的ROX荧光强度也应该是一样的。由于ABI的仪器检测荧光是用CCD模式,由于检测角度的不同,会形成荧光强度的管间差,这样,就会影响以荧光强度表示PCR产物多少的定量准确性。检测ROX的荧光强度,并根据ROX的荧光强度变化,去除这种管间差,可以使得FAM的检测更准确。ROCHE、ROTOR GENE的仪器仪器不存在光强差,一般不需要用ROX进行校正。
笛医qPCR SmArt Mix系列为您提供多种qPCR扩增预混液选择,做您最贴心的实验管家:
产品名称 | 产品编号 | 规格 | 适用机型 |
2×qPCR SmArt Mix(SYBR Green)(No Rox) | DY20301 | 5×1 mL | Bio-Rad CFX全系列、Roche LightCycler™系列、 Eppendorf Mastercycler® ep realplex系列、Qiagen Corbett Rotor-Gene®系列、Takara Thermal Cycler Dice Analytikjena qTOWER系列等 |
2×qPCR SmArt Mix(SYBR Green)(Low Rox) | DY20302 | 5×1 mL | ABI 7500,7500 Fast,ViiA™7,QuantStudio™系列 Stratagene MX3000P™,MX3005P™,MX4000™等 |
2×qPCR SmArt Mix(SYBR Green)(High Rox) | DY20303 | 5×1 mL | ABI 7000,7300,7700,7900HT,7900HT Fast, StepOne™,StepOne Plus™等 |
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